Histone H3 Antikörper
Epigenetik ist die Untersuchung vererbbarer zellulärer und physiologischer Eigenschaften durch andere Faktoren als die DNA-Sequenz. Beispiele sind einfache chemische Modifikationen, wie Methylierung und Acetylierung zu DNA und interagierenden Partnern. Da die Struktur der jeweiligen Base erhalten bleibt, ist die DNA-Methylierung keine Genmutation, sondern eine Modifikation. Diese Veränderungen sind jedoch eine Rolle bei der Kontrolle, wie, wo und wann bestimmte Gene exprimiert werden.
Antikörper gegen Histon 3 Modifikationen
| Position | Unmodified | Methylation | Di-Methylation | Tri-Methylation | Acetylation |
|---|---|---|---|---|---|
| Arginin 2 | - | - | |||
| Arginin 8 | - | - | - | ||
| Arginin 17 | - | - | - | ||
| Arginin 26 | - | - | - | ||
| Lysine 4 | - | ||||
| Lysine 9 | - | ||||
| Lysine 14 | |||||
| Lysine 18 | |||||
| Lysine 23 | |||||
| Lysine 27 | |||||
| Lysine 36 | - | ||||
| Lysine 37 | - | ||||
| Lysine 56 | - | - | |||
| Lysine 64 | - | - | - | - | |
| Lysine 79 | - | - | |||
| Lysine 122 | - | - | - | - |
Histon H3K27m3 - Herunterfahren der Transkription
H3K27me3 ist ein gut erforschtes Ziel epigenetischer Wissenschaftler, die nach inaktiven Genen suchen. Im Gegensatz zu anderen Histonmethylierungen hat H3K27m3 nur eine bekannte Methyltransferase: EZH2. EZH2 ist verantwortlich für die Unterdrückung vieler Gene, die an der Entwicklung und Zelldifferenzierung beteiligt sind. Daher ist H3K27m3 entscheidend für die Unterdrückung von Entwicklungsgenen. Wenn H3K27 trimethyliert ist, ist es eng mit inaktiven Genpromotoren verbunden.
Die Mono- und Dimethylierungszustände sind weniger untersucht, jedoch zeigt H3K27m2 eine ähnliche Verteilung wie H3K27, während H3K27m1 mit aktiven Promotoren assoziiert ist. H3K27 kann auch Ziel der Acetylierung sein. Lysinreste können nur methyliert oder acetyliert werden, im Vergleich dazu führt die Acetylierung zu gegenteiligen Effekten - mit aktiver Transkription und Antagonismus von H3K27m3 regulierten Genen.
Mehrere Ansätze sind für die Untersuchung von Histonen geeignet, darunter die Chromatin-Immunpräzipitation (zusammen mit den großen Varianten ChIP-on-Chip und ChIP-Seq), die fluoreszierende in situ-Hybridisierung oder die Bisulfit-Sequenzierung. Seit Anfang 2019 steht mit CUT&RUN (cleavage under targets and release using nuclease) eine Weiterentwickelung obengenannter Methoden zur Verfügung die inbesondere Hintergrundrauschen bei der Sequenzierung minimiert.
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