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Protein Exosom Marker

Geschrieben/Bearbeitet von Dr. Stefan Pellenz, PhD

Exosomen sind extrazelluläre Mikrovesikel (EMV), die von den meisten an der interzellulären Kommunikation beteiligten Zellen ausgeschieden werden. Sie sind in Körperflüssigkeiten vorhanden und können je nach Wirtszelle eine Vielzahl verschiedener Proteine enthalten. Ihr Inhalt wird außerdem durch den Zellzustand wie Stress oder Aktivierung oder Hemmung bestimmter Signalwege moduliert. Dies macht Exosomen zu hervorragenden Biomarkern für Flüssigbiopsien, z. B. bei der Krebsdiagnose.

Exosomen-Biogenese und Protein-Marker

Die Biogenese von Exosomen beginnt mit der Einstülpung von frühen Endosomen. Diese reifen zu späten Endosomen und dann weiter zu multivesikulären Körpern (MVBs). Bei der Bildung von MVBs wird die endosomale Membran nach innen geknotet, was zur Sequestrierung von Zytoplasmakomponenten in intraluminale Vesikel (ILVs) führt. Die ILVs werden durch Exozytose in den extrazellulären Raum freigesetzt, was den Exosomen ihren Namen einbrachte. Exosomen können eine Vielzahl von Exosomen-Proteinmarkern enthalten, je nachdem, welche Wirtszelle sie beherbergen und in welchem Zustand sich die Zelle befindet (z. B. Stress, Aktivierung oder Hemmung bestimmter Signalwege). Tetraspanine wie CD9, CD63 und CD81 sind die häufigsten kanonischen Exosomenmarkerproteine. Durch ihre Oberflächenlokalisierung eignen sich Tetraspanine besonders gut für die Immunmarkierung und Reinigung von Exosomen aus biologischen Proben. Komponenten des für den Transport erforderlichen endosomalen Sortierkomplexes (ESCRT) wie TSG101 und Alix, Zytoskelettproteine, Integrine und Annexine sind ebenfalls auf Exosomen angereichert. Diese Moleküle spielen eine zentrale Rolle bei der Ausrichtung von Exosomen und der Zelladhäsion.

Was sind Exosomen?

Exosomen sind kleine (50-120 nm) aus Endosomen stammende extrazelluläre Mikrovesikel (EMV), die eine entscheidende Rolle bei der interzellulären Kommunikation spielen, indem sie verschiedene Biomoleküle wie Proteine, Lipide und Nukleinsäuren zwischen den Zellen transportieren. Sie wurden erstmals in den frühen 1980er Jahren in den Kulturmedien von Retikulozyten beobachtet. Der Begriff Exosom basiert auf der Beobachtung, dass sie durch Exozytose in das extrazelluläre Medium freigesetzt werden. Exosomen weisen eine ähnliche Topologie wie die Plasmamembran auf und werden von praktisch allen Zelltypen freigesetzt und wurden in allen Körperflüssigkeiten nachgewiesen.

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Wie entstehen Exosomen?

Die Biogenese von Exosomen beginnt in der Regel mit der Internalisierung von extrazellulärem Material durch Endozytose, was zur Bildung von frühen Endosomen führt, die membrangebundene Organellen sind und die internalisierte Fracht enthalten. Diese reifen dann zu späten Endosomen heran, ein Prozess, der von Veränderungen der Membranzusammensetzung und der Sortierung der Ladung begleitet wird. Späte Endosomen können sich zu MVBs entwickeln, die durch das Vorhandensein von intraluminalen Vesikeln (ILVs) gekennzeichnet sind, die durch Einstülpung der endosomalen Membran gebildet werden. In den MVB werden Proteine, Lipide, Nukleinsäuren und andere Moleküle in ILVs sortiert. Diese Sortierung ist ein entscheidender Schritt in der Exosomenbiogenese und wird durch die für den Transport erforderlichen endosomalen Sortierkomplexe (ESCRT) erreicht. Der ESCRT besteht aus mehreren Proteinkomplexen (ESCRT-0, ESCRT-I, ESCRT-II, ESCRT-III), die zusammenarbeiten, um Ladung zu erkennen und in knospende ILVs einzuschließen. MVBs können dann entweder mit Lysosomen fusionieren, um abgebaut zu werden, oder sie können mit der Plasmamembran fusionieren und die ILVs als Exosomen in den extrazellulären Raum freisetzen.

Wie werden Exosomen Identifiziert?

Exosomen enthalten je nach Wirtszelle eine Vielzahl unterschiedlicher Proteine, und ihre Bestandteile werden durch den Zellzustand (z. B. Stress, Aktivierung oder Hemmung bestimmter Signalwege) weiter moduliert. Tetraspanine wie CD9, CD63 und CD81 sind die häufigsten kanonischen Exosomen-Markerproteine, die auf der Vesikeloberfläche vorhanden sind. Die Oberflächenlokalisierung von Tetraspanin-Antigenen macht sie zu guten Kandidaten für die Immunmarkierung und Reinigung von Exosomen aus biologischen Proben. Komponenten des für den Transport erforderlichen endosomalen Sortierkomplexes (ESCRT) wie TSG101 und Alix, Zytoskelettproteine, Integrine und Annexine sind ebenfalls auf Exosomen angereichert; diese Moleküle spielen eine zentrale Rolle bei der Ausrichtung von Exosomen und der Zelladhäsion.

Warum sind Exosomen wichtig?

Die Sekretion von Exosomen erfolgt konstitutiv, obwohl die Rate der Exosomensekretion und die Zusammensetzung von Exosomen durch eine Vielzahl von intrinsischen oder extrinsischen Faktoren (z. B. Zellstress, Signalkaskaden) erhöht werden kann. Trotz ihrer ubiquitären Natur werden Exosomen als unkonventionelle Bestandteile des sekretorischen Weges angesehen.

Da Exosomen von fast allen Zelltypen sezerniert werden, spiegelt ihre Zusammensetzung die Vielfalt ihrer Wirte wider und hängt stark von der Art der Zelle ab, aus der sie stammen. Ihre molekulare Zusammensetzung spiegelt auch physiologische oder pathophysiologische Veränderungen in ihrer Ursprungszelle oder ihrem Ursprungsgewebe wider. Dies macht Exosomen zu hervorragenden Biomarkern für Flüssigbiopsien zur Diagnose und Verfolgung des Krankheitsverlaufs. Für die Krebsdiagnostik haben Exosomen gegenüber zirkulierenden Tumorzellen (CTCs) oder zirkulierender Tumor-DNA (ctDNA) aufgrund ihrer Häufigkeit, Stabilität und der großen Vielfalt der enthaltenen Markermoleküle erhebliche Vorteile.

Exosomen sind auch an der Zell-Zell-Kommunikation beteiligt. Exosomenkomponenten können direkt auf benachbarte Zellen übertragen werden oder durch verschiedene Zellen wandern, bevor sie über eine als Transzytose bekannte Methode ihr Ziel erreichen. Auf diese Weise können Exosomen Signale über große Entfernungen übertragen, bei denen eine einfache Diffusion unzureichend sein kann. Ihre Rolle bei der Zell-Zell-Kommunikation lässt vermuten, dass Exosomen bei vielen physiologischen Prozessen eine tiefere Rolle spielen. Diese Hypothese wird durch die Beobachtung gestützt, dass die Exosomen-Signalübertragung eine direkte Rolle bei der Entwicklung und Musterbildung, der Immunantwort, der neuronalen Kommunikation und der Gewebereparatur spielt.

Bei einigen Pathologien fungieren Exosomen auch als Vektoren; von Tumorzellen stammende Exosomen spielen eine aktive Rolle bei der Angiogenese und Metastasierung von Tumoren. Exosomen, die von stimulierten Blutzellen und dem Gefäßendothel abgegeben werden, sind an neurologischen Erkrankungen wie Multipler Sklerose, transitorischen ischämischen Attacken und dem Antiphospholipid-Syndrom beteiligt. Exosomen können auch beschädigtes Zellmaterial transportieren. Sie erleichtern die Verbreitung toxischer Formen aggregierter Proteine wie α-Synuclein und β-Amyloid und tragen zum Fortschreiten neurodegenerativer Erkrankungen bei. Einige Forschungsarbeiten deuten auch darauf hin, dass der Exosomen-Transport von viralen Krankheitserregern wie SARS-CoV-2 ausgenutzt wird, um zwischen den Wirtszellen zu wandern und der Immunerkennung zu entgehen. Aufgrund ihrer geringen Größe und einfachen Struktur können Exosomen manchmal die Blut-Hirn-Schranke überwinden. Es wurde vorgeschlagen, dass Exosomen als Verabreichungssystem für das zentrale Nervensystem dienen könnten, um neuropathische Krankheiten ohne invasive Eingriffe zu behandeln. Die Verwendung von Exosomen zur Übertragung genetischer Informationen oder zur Verabreichung von therapeutischen Wirkstoffen ist ein derzeit noch wenig erforschtes Gebiet, das ein großes medizinisches Potenzial birgt.

Wie untersucht man Exosomen?

Das Exosom-Sekretom ist groß und vielfältig und enthält viele verschiedene Marker (siehe http://www.exocarta.org/). Das Vorhandensein von kanonischen Oberflächenmarkern wie den oben genannten ermöglicht die Reinigung und eingehende Untersuchung der Exosomensekretion und des Exosomeninhalts aus verschiedenen Probentypen.

antibodies-online bietet eine Reihe von Antikörpern und ELISA-Kits für den Nachweis von bekannten Exosomen-Proteinen an.

Exosome Marker Antikörper

Aus der jüngsten Literatur geht hervor, dass zu den wichtigsten Protein-Exosom-Markern folgende gehören:

Protein Gen GeneID Uniprot Ref exocarta Top 100 Proteine TS EF LP TA CS AG MT AP HS EN RG CA II VI ND
14-3-3 protein epsilon YWHAE 7531 P62258 - 22 X
14-3-3 protein beta/alpha YWHAB 7529P3194650x
14-3-3 protein eta YWHAH7533Q0491794x
14-3-3 protein gamma YWHAG 7532P6198154x
14-3-3 protein theta YWHAQ 10971P2734856x
14-3-3 protein zeta/delta YWHAZ 7534 P63104 - 15 X
78 kDa glucose-regulated protein HSPA5 3309 P11021 (1) 35 X
Actin, cytoplasmic 1 ACTB 60 P60709 - 5 X
ADAM10 ADAM10 102 O14672 (2) - X X X X
Alix PDCD6IP 10015 Q8WUM4 (3) 2 X
Alpha-Enolase ENO1 2023 P06733 (4) 9 X
Alpha-Synclein SNCA 6622 P37840 (32) - X X
Aminopeptidase N ANPEP 290 P15144 - - X X
Beta-amyloid APP 351 P05067 (5) - X
Annexin A1 ANXA1301P0408353x
Annexin A11 ANXA11311P5099568x
Annexin A4 ANXA4307P0952572x
Annexin A6 ANXA6309P0813367x
Annexin A5 ANXA5 308 P08758 (6) 20 X X
Annexin A2 ANXA2 302 P07355 (7) 6 X
AP-1 JUN 3725 P05412 - - X X
ATP citrate lyase ACLY 47 P53396 - 72 X
ATPase ATP1A1 476 P05023 - 39 X
Basigin BSG 682 P35613 (8) - X X
Caveolin-1 CAV1 857 Q03135 (9), (10) - X X
CD9 CD9 928 P21926 (11) 1 X
CD11a ITGAL 3683 P20701 (12) - X X
CD11b ITGAX 3687 P11215 (12) - X X
CD11c ITGAM 3684 P20702 (12) - X X
CD29 ITGB1 3688 P05556 (12) 34 X X
CD37 CD37 951 P11049 (11) - X
CD44 CD44 960 P16070 (13) - X X
CD49f ITGA6 3655 P23229 (12) 89 X X
CD53 CD53963P19397-x
CD63 CD63 967 P08962 (10), (11) 7 X X
CD81 CD81 975 P60033 (14) 24 X X
CD82 CD82 3732 P27701 (11) - X
CD142 TF 2152 P13726 (15) - X X
CD146 MCAM 4162 P43121 (15) - X X
CD163 CD163 9332 Q86VB7 (15) - X X X
Clathrin heavy chain 1 CLTC 1213 Q00610 - 23 X
Claudin-1 CLDN1 9076 O95832 (8) - X
Cofilin-1 CFL1 1072 P23528 - 25 X
- - (16) - X
- - (16) - X
EF-1-alpha-1 EEF1A1 1915 P68104 (4) 14 X
EF2 EEF2 1938 P13639 - 17 X
EGFR EGFR 1956 P00533 (15) - X
Ep-CAM EPCAM 4072 P16422 (17), (18) - X X
Fatty acid synthase FASN 2194 P49327 (3) 21 X X
Fibronectin FN12335P0275193
Flotillin-1 FLOT1 10211 O75955 (18), (19) 41 X X
Flotillin-2 FLOT2 2319 Q14254 (19) - X
Fructose-bisphosphate aldolase A ALDOA 226 P04075 - 18 X
Gelsolin GSN2934P0639692xx
Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase GAPDH 2597 P04406 - 4 X
HCV core protein - - (20) - X
Heat shock 70 kDa protein 1A HSPA1A3303P0DMV851x
Heat shock protein HSP 90-alpha HSP90AA1 3320 P07900 (1) 10 X X
Heat shock protein HSP 90-beta HSP90AB1 3326 P08238 (1) 19 X
Heparanase HPSE 10855 Q9Y251 (21) - X X
- - (20) - X
- - (20) - X
HLA-DRA HLA-DRA 3122 P01903 (22) - X X X
HLA-G 3135 P17693 (23) - X X X
Hsc70 HSPA8 3312 P11142 (1) 3 X
- - (16) - X
Tax - - (20) - X
Huntingtin HTT 3064 P42858 (5) - X X
ICAM-1 ICAM1 3383 P05362 (24) - X
Leucine-rich receptor kinase 2 LRRK2 120892 Q5S007 (5) - X
L-lactate dehydrogenase A chain LDHA 3939 P00338 - 13 X
Lysosome-associated membrane glycoprotein 1 LAMP1 3916 P11279 (25) - X X
Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 LAMP2 3920 P13473 (23) 88 X X
MHCI - - (26) - X X
MHCII - - (26) - X X
MUC1 MUC1 4582 P15941 (15) - X X
N-cadherin CDH2 1000 P19022 (15) - X X
Phosphoglycerate kinase 1 PGK1 5230 P00558 (4) 16 X
Placental Alkaline Phosphatase ALPP 250 P05187 (15) - X X
Prion proteins - - (5) - X
Prostate-specific antigen KLK3 354 P07288 (27) - X X
Pyruvate kinase PKM PKM 5315 P14618 (28) 12 X X
Rab-14 RAB14 51552 P61106 - 75 X
Rab-5a RAB5A 5868 P20339 - 80 X
Rab-5b RAB5B 5869 P61020 - 86 X
Rab-5c RAB5C 5878 P51148 - 64 X
Rab-7 RAB7A 7879 P51149 - 61 X
Rap 1B RAP1B 5908 P61224 - 33 X
Superoxide dismutase SOD16647P00441-xx
Syndecan-1 SDC1 6382 P18827 (29) - X
Syndecan-4 SDC4 6385 P31431 (29) - X
Syntenin-1 SDCBP 6386 O00560 (30) 8 X
TARDBP TDP-4323435Q13148-x
Transitional endoplasmic reticulum ATPase VCP7415P5507226
Triosephosphate isomerase TPI17167P6017427x
Tumor-Associated Glycoprotein TAG-72 - - (15) - X
Tetraspanin-8 Tspan8 7103 P19075 (15) - X X
Tsg101 TSG101 7251 Q99816 (31) 11 X
Tubulin alpha-1C chain TUBA1C84790Q9BQE3-x
Tubulin alpha-4A chain TUBA4A7277P68366-x
Tubulin beta-2B chain TUBB2B347733Q9BVA1-x
Tubulin beta-4B chain TUBB4B10383P68371-x
Vacuolar-sorting protein 35 VPS35 55737 Q96QK1 (5) - X X

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Stefan Pellenz
Dr. Stefan Pellenz, PhD
Product Manager at antibodies-online.com

Goal-oriented, time line driven scientist, proficiently trained in different academic institutions in Germany, France and the USA. Experienced in the life sciences e-commerce environment with a focus on product development and customer relation management.

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